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分子診斷與個體化治療.ppt湖南省中西醫(yī)結(jié)合學會檢驗醫(yī)學專業(yè)委員會.ppt

文檔格式:PPT| 39 頁|大小 501KB|積分 10|2024-11-12 發(fā)布|文檔ID:252050657
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  • 單擊此處編輯母版標題樣式,單擊此處編輯母版文本樣式,第二級,第三級,第四級,第五級,*,臨床分子診斷與個體化治療,分子診斷,狹義分子診斷:,應用分子生物學方法檢測患者體內(nèi)遺傳物質(zhì)的結(jié)構(gòu)或表達水平的變化而做出診斷的技術(shù),稱為分子診斷,包括腫瘤分子診斷、傳染病分子診斷、產(chǎn)前診斷等廣義分子診斷:,指應用分子生物學方法,對受檢者體內(nèi)各類生物分子(包括,DNA,、,RNA,、蛋白質(zhì)等)進行定性和定量分析,確定其結(jié)構(gòu)或表達水平,從而為個性化預防、治療提供依據(jù)的一種診斷技術(shù),包括腫瘤分子診斷、傳染病分子診斷、產(chǎn)前診斷、單基因診斷、易感基因檢測以及天賦基因檢測等PCR,國內(nèi)回顧,1990,年,:PCR,技術(shù)在國內(nèi)開始用于臨床檢測,90,年代中期,:,假陰性,?/,假陽性,?,引發(fā)思考,1996,年,:,衛(wèi)生部科研課題,1998,年,3,月,20,日,:,臨床,PCR,實驗室管理專家咨詢會,1998,年,4,月,16,日,:,衛(wèi)生部下發(fā),國內(nèi)回顧,2,1999,年,4,月,29-30,日,:,針對臨床開展,PCR,檢驗的問題,達成八點意見,.,1999,年,8,月,17-24,日,:(,在北京衛(wèi)生部臨床檢驗中心舉辦,.,2002,年,1,月,14,日,:,衛(wèi)生部下發(fā),(,衛(wèi)醫(yī)發(fā),200210,號,),2010,年,:,醫(yī)療機構(gòu)臨床基因擴增檢驗實驗室管理辦法,(衛(wèi)辦醫(yī)政發(fā),【2010】194,號),醫(yī)療機構(gòu)臨床基因擴增檢驗室工作導則,(衛(wèi)辦醫(yī)政發(fā),【2010】194,號),截止到,2014,年,1,月,全國按照所制定的標準通過驗收的臨床基因擴增檢驗實驗室共,2670,余家。

    采用所編寫的培訓教材和培訓模式共舉辦了培訓班,280,多期,培訓實驗室技術(shù)人員,21000,多人涉及全國,28,個省、直轄市和自治區(qū)目前國內(nèi)臨床分子診斷現(xiàn)狀,絕大部分用于病原體核酸檢測,較少部分用于遺傳病的產(chǎn)前診斷,個體化用藥的分子診斷正在興起,一些常見的認識誤區(qū),臨床實驗室,=,檢驗科,基因(遺傳攜帶、突變等)與病原體核酸檢測,完全不同,臨床,PCR,檢驗在,病理科,、,藥劑科,或,腫瘤科,做,不屬于臨床檢驗管理?,必須達成一點共識:實驗不管在哪做,都屬于檢驗管理,必須有嚴格的質(zhì)量控制問題與思考,問題:,應用,實驗室分區(qū),質(zhì)量管理:分析前,分析中,分析后,人員,:(醫(yī)生、實驗室技術(shù)人員):均需,“,洗腦,”,嚴格的培訓,出現(xiàn)問題,即分析問題產(chǎn)生的原因,采取措施加以改進,質(zhì)理管理的習慣養(yǎng)成需要時間幾個策略比較,家族病史研究與基因研究相比較,說法不一,孰優(yōu)孰劣?各有所長腫瘤早期診斷帶來的真正收益有沒有我們所希望的那么大?,WHO has developed three principles for cancer issues,Current prevention strategies could block up to one-third of all new cancer,Improved early sreening could result in the detection of one-third of cancer at an early stage,。

    A comprehensive treatment could improve survial aquality another one-third of pattients with cancer,國家自然科學基金委醫(yī)學部主任、國家肝癌科學中心主任,王紅陽院士,,中國腫瘤治療現(xiàn)狀,治愈率,130mg/dl,、,HCV RNA600000U/ml,預期治愈率可能大于,80%,個性化檢測的局限性,一些疾病是由一個或多個基因突變引起,基因檢測方法確實能對這些疾病的患病風險、確診和治療起指導作用,大多數(shù)疾病發(fā)生、發(fā)展及預后可能涉及更多的基因以及這些基因和環(huán)境因素相互作用,僅通過基因檢測盒基因表達譜的檢測有很大局限性,CLIA,:分子檢測有關的主要質(zhì)控要求,對于每一個檢測系統(tǒng),實驗室由此又控制程序的責任,監(jiān)控整個分析過程的準確性和精密度42 CFR 493.1256,(,A,),),控制程序必須是:,o,檢出即時誤差,由檢測系統(tǒng)故障、不利于環(huán)境和操作者能力導致,(42 CFR 493.1256,(,C,)(,1,),),o,監(jiān)控檢測性能的準確性和精密度,檢測系統(tǒng)能和環(huán)境的改變以及操作者的能力都可能會影響檢測性能。

    實驗室必須確定使用檢測物質(zhì)的數(shù)量、類型和頻率,如果適用,由實驗室驗證或建立性能規(guī)范,(42 CFR 493.1256,(,b,),),如果實驗室引進了未經(jīng),FDA,認可或批準的檢測系統(tǒng),包括自主研制的方法,在報告病人檢測據(jù)結(jié)果前,必須建立檢測系統(tǒng)的性能規(guī)范,如果適用,包括下面的性能特征:,o,準確性,,o,精密度,,o,分析靈敏性,,o,分析特異性,包括干擾物質(zhì)檢測系統(tǒng)對檢測結(jié)果的可報告區(qū)間,,o,參考區(qū)間(正常值),和,o,檢測性能要求的其他性能特征42 CFR 493.1253,(,b,)(,2,),),包括提取過程中的檢測系統(tǒng)包括兩種質(zhì)控物質(zhì),其中之一可以檢出提取過程的錯誤42 CFR 493.1256,(,d,)(,3,)(,iv,),),每一擴增過程,包括兩種質(zhì)控材料,如果反應的抑制是假陰性結(jié)果的重要來源一個質(zhì)控材料能夠檢出該抑制作用42 CFR 493.1256,(,d,)(,3,)(,v,),),國際相關機構(gòu)的,PT,計劃,CAP,美國病理家協(xié)會,CDC,美國疾病預防控制中心(基因檢測質(zhì)量控制物計劃,GTQC,),QCMD,分子診斷的質(zhì)量控制,EMQN,歐洲分子遺傳實驗質(zhì)控網(wǎng),ENVID,歐洲重要病毒性疾病診斷網(wǎng),EQAP,西班牙室間質(zhì)評計劃,EQUAL,歐盟質(zhì)量控制一致行動(現(xiàn)在被稱作分子診斷的質(zhì)量控制,QCMD,),INQAT,意大利腫瘤標志物質(zhì)量保證網(wǎng),NEQAS,英國國家質(zhì)量保證計劃,臨床基因擴增實驗室的質(zhì)量控制(一),實驗室各種常規(guī)工作的規(guī)章制度,實驗室技術(shù)人員的生物安全制度和保護措施,防止實驗室,PCR,交叉污染的實驗(每月一次),實驗室的清潔和消毒制度(每周,4-5,次),實驗室的原始數(shù)據(jù)、報告單的歸檔和信息保密制度,實驗室專業(yè)人員的培訓和考核制度,實驗室結(jié)果差錯的記錄和糾正措施,計算機的系統(tǒng)維護和管理制度,臨床基因擴增實驗室的質(zhì)量控制(二),樣本接收和拒收標準:抗凝劑,采集時間,/,量,病史。

    接收標本必須有專用的登記表,并核對樣本登記表中的所有信息,,2,人復核和簽字每批樣本核酸提取的過程中加入質(zhì)控標本以保證標本處理的過程中的正確性,同時建立用于不同技術(shù)平臺的標準化的,DNA/RNA,濃度范圍定量,PCR,檢測的操作過程包括,4,個不同濃度的對照物,以及陰性和陽性對照樣本的保存和存儲(,4,和,-80,冰箱),臨床基因擴增實驗室質(zhì)量控制(三),室內(nèi)質(zhì)控標本的來源:包括參加國內(nèi)和國際質(zhì)控標本,細胞株和已知實驗結(jié)果的樣本在每批實驗中和每個技術(shù)平臺上均加入了質(zhì)控樣本,從樣本抽提,基因擴增,雜交和測序已知跟蹤到整個實驗結(jié)果,每次實驗結(jié)果分析后有專門的質(zhì)控報告實驗室的技術(shù)人員每一個月,在每一個技術(shù)平臺上都有一次盲樣樣本的質(zhì)控實驗,并以此評價技術(shù)人員的實驗技能分析的有效性,準確性,o,與參考方法比較,o,設定,CUT-OFF,值的方法,精密度,/,再現(xiàn)性,o,重復性:利用分子檢測方法和同一個儀器對單個樣本進行重復性研究o,再現(xiàn)性:再現(xiàn)性研究評估天與天、操作與操作間的精密度、如果使用多個儀器,要評估儀器與儀器之間的再現(xiàn)性;如果在多個實驗室開展檢測,也要評估不同實驗室間的再現(xiàn)性O,靠近臨床,cut-point,和整個分析檢測區(qū)間內(nèi)的性能,分析的線性、回收率和高劑量鉤子效應,檢出限值和定量限值(在高和低的范圍內(nèi)),分析特異性(交叉反應,干擾),基質(zhì)效應,影響分析結(jié)果的分析前因素,分析輸出(讀數(shù)區(qū)間或陰陽性),臨床有效性和臨床有用性,臨床有效性:檢測特性(敏感性、特異性、預測值和擬然比),臨床有用性:利用檢測結(jié)果可以獲得有效治療或其他具體的臨床獲益,篩選有癥狀個體的檢測:基因,LRRK2-G2019S,突變帕金森癥。

    用于診斷和監(jiān)控的檢測:,Heptimax-,由,Quest Diagnostics,研制的實驗室自制檢測該檢測用于確認活動性丙肝病毒(,HCV,)感染、監(jiān)控,HCV,治療反應和確認感染的消退確定預后和指導治療的檢測:,OncotypeDX,利用實時熒光定量,PCR,檢測乳腺癌腫瘤組織樣本中,21,個基因的表達水平調(diào)整用藥劑量的檢測:指導華法林劑量的基因檢測,-,基因,CYP2C9,(編碼細胞色素,P4502c9,)和,VKORC1,(編碼維生素,K,環(huán)氧化物還原酶復合物亞單位,1,)的多態(tài)性病理說明:,1.,包括“尸體病理學診斷”、“細胞病理學檢查與診斷”、“組織病理學檢查與診斷”、“分子病理學技術(shù)與診斷”、“特染和免疫組織化學染色與診斷”、“電子顯微鏡技術(shù)與診斷”和“其他”項目七個部分,共計,53,項檢驗說明:,1.,包括“臨床血液學檢驗”、“臨床體液檢驗”、“臨床化學檢驗”、“臨床免疫學檢驗”、“臨床微生物與寄生蟲學檢驗”和“臨床分子生物學檢驗”項目六個部分,共計,1104,項2.,組織器官移植所需的各項檢驗(如,HLA,檢查等)列入“臨床血液學檢驗”類的“血型、輸血及人類組織相關性抗原檢驗”類中。

    3.”,實驗室診斷,”,中的項目不含靜脈采血,需單獨收費,但微量采血管(指尖采血、耳垂采血)包含在各檢驗項目中,不得單獨收費四)分子病理學技術(shù)與診斷,BDAA0001,組織部,/,細胞原位雜交檢查診斷,石蠟包埋組織,新鮮冷凍組織,細胞涂片,組織切片機切片,進行二甲苯脫蠟,系列乙醇水化,微波爐、高壓鍋及蛋白酶處理,標記探針雜交反應,洗滌,酶或親和物結(jié)合反應,顯色,判讀結(jié)果,含上述過程中所產(chǎn)生的廢液、廢物的處理BDAB0001,組織部,/,細胞熒光原位雜交檢查診斷,熒光素標記探針雜交反應(一種探針)BDAB0002,組織部,/,細胞多色熒光原位雜交檢查診斷,熒光素標記探針雜交反應(二種或以上探針),.,BDAB0003,組織部,/,細胞熒光原位雜交技術(shù)計量分析診斷,熒光素標記探針雜交反應(二種或以上探針),圖像定量分析BDAC0001,組織部,/,細胞原位脫氧核糖核酸(,DNA,)多聚酶鏈式反應檢查診斷,原位,PCR,反應,親和物結(jié)合,顯色,復染,觀察,診斷BDAD0001,組織部,/,細胞原位核糖核酸(,RNA,)多聚酶鏈式反應檢查診斷,原位逆轉(zhuǎn)錄,PCR,反應,親和物結(jié)合,顯色,復染,觀察,診斷。

    BDAE0001,組織部,/,細胞熒光定量脫氧核糖核酸(,DNA,)多聚酶鏈式反應檢查診斷,甲醛固定組織,石蠟包埋組織,新鮮或冷凍組織,離心收集細胞;組織粉萃機勻漿化,組織裂解,經(jīng)反復離心及相應化學試劑去除蛋白,回收,DNA,,于熒光,PCR,儀進行熒光素,PCR,反應,分析結(jié)果,診斷BDAF0001,組織部,/,細胞熒光定量核糖核酸(,RNA,)多聚酶鏈式反應檢查診斷,回收,RNA,,于于熒光,PCR,儀進行熒光素逆轉(zhuǎn)錄,-PCR,反應,分析結(jié)果,診斷BDAG0001,腫瘤組織脫氧核糖核酸(,DNA,)測序,PCR,反應產(chǎn)物瓊脂糖或聚丙烯酰胺凝膠電泳,產(chǎn)物純化,測序反應,于,DNA,測序儀分析,觀察結(jié)果,診斷甲醛固定組織,,石蠟包埋組織,新鮮或冷凍組織,血液或體液的處理,,DNA,提取,,PCR,反應及最后的測序反應純化臨床分子生物學及細胞遺傳學檢驗,CLAY8000 HIV-,核糖核酸擴增定量檢測,CLAZ8000 HIV-,核糖核酸非擴增定性檢測,CLBA8000,分枝桿菌菌種鑒定,CLBB8000,結(jié)核,/,非結(jié)核分枝桿菌核酸檢測,CLBC8000,巨細胞病毒脫氧核糖核酸擴增定性檢測,CLBD8000,巨細胞病毒脫氧核糖核酸擴增定量。

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